随着互联网和新经济的发展，越来越多的人选择灵活用工，成为自由职业者或者兼职工作者。然而，灵活用工个人所得税的问题却一直困扰着他们和用工企业。那么，灵活用工个人所得税到底由企业还是个人承担呢？

首先，我们需要了解灵活用工个人所得税的计算方法。根据《中华人民共和国个人所得税法》规定，个人所得税的计算方法为：应纳税所得额 = 收入总额 - 费用扣除 - 专项扣除 - 赡养老人扣除 - 子女教育扣除 - 继续教育扣除 - 住房租金扣除 - 其他扣除。其中，费用扣除是指个人在取得所得时支出的与所得有关的必要费用。对于灵活用工来说，这些必要费用包括交通、通讯、办公、材料等等。

在这个计算方法的基础上，我们来看灵活用工个人所得税的承担方。根据《个人所得税法》的规定，个人所得税的纳税义务人是所得者。也就是说，灵活用工个人所得税的纳税义务人是灵活用工者本人。因此，灵活用工个人所得税应由个人承担。

但是，企业在与灵活用工者签订合同时，可以在合同中约定企业为灵活用工者代扣个人所得税。这种做法在实际操作中比较常见，也是企业为了吸引和留住优秀的灵活用工者而采取的一种措施。但是，企业代扣个人所得税并不意味着企业承担了个人所得税的义务，只是在纳税时起到了代理的作用。

那么，企业代扣个人所得税的具体操作流程是怎样的呢？首先，企业需要在灵活用工者的收入中扣除个人所得税。其次，企业需要在每个月的15日前将代扣的个人所得税缴纳给税务机关。最后，企业需要在每年的3月1日至6月30日之间，向税务机关报送灵活用工者的个人所得税代扣申报表。

总之，灵活用工个人所得税的承担方是个人，但企业可以在合同中约定代扣个人所得税。企业代扣个人所得税的具体操作流程需要遵循相关的税务规定。对于灵活用工者来说，需要了解个人所得税的计算方法和纳税义务，合理合法地处理个人所得税问题。对于企业来说，需要了解个人所得税代扣的相关规定，遵守税务法规，为灵活用工者提供更好的服务和保障。

在灵活用工越来越普遍的今天，灵活用工个人所得税的问题也越来越重要。希望本文能够为灵活用工者和企业提供一些参考和帮助。